Derleme Yazı /
Review Article [ Article in Turkish ] |
doi: 10.46683/jmvi.2020.2 |
|||||||
Makale Değerlendirme Sürecinin Özeti
[ →→
] |
Summary of the Article Evaluation Process [ →→
] |
|||||||
SARS-Cov-2 ve Diğer Koronavirusların
Genomik ve Biyolojik Özellikleri |
||||||||
Genomic and Biologic Characteristics of SARS-CoV-2 and Other
Coronaviruses |
||||||||
1Department of
Medical Microbiology, Gulhane Medical Faculty, University of Health Sciences, Ankara, Türkiye. |
||||||||
Article Info: Received; 10.04.2020. Accepted; 28.04.2020. Published; 29.04.2020. Correspondence: Fatih Şahiner;
Assoc.Prof., Department
of Medical Microbiology, Gulhane Medical Faculty, University of Health Sciences, Ankara, Türkiye.
E-mail: fsvirol@gmail.com |
||||||||
|
||||||||
Özet Koronaviruslar
iyi tanımlanmış insan ve hayvan patojenleri olup, insanlarda başlıca solunum
yolu enfeksiyonları ile ilişkilidirler. Sayıları 40’a yakın olan koronavirus
türlerinden yedisi insan enfeksiyonları ile ilişkilidir. Bu virüslerden dördü
(HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 ve HCoV-HKU1) mevsimsel enfeksiyonlara neden
olan solunum yolları patojenleri iken, özellikle hastane salgınları ile
karşımıza çıkan SARS-CoV ve MERS-CoV ise ciddi solunum yolu enfeksiyonlarına
neden olan türler olarak ilk kez 2003 ve 2012 yıllarında tanımlandı. SARS-CoV
ile genomik benzerliği nedeniyle Uluslararası Virüs Taksonomi Komitesi
tarafından SARS-CoV-2 olarak adlandırılan yeni bir tür 2019 yılı sonlarında
Çin’den başlayarak 3 ay içerisinde tüm dünyaya yayıldı. Gelişmiş ülkelerde
sağlık sistemlerinin çöküşü ve dünya genelinde neden olduğu yaygın endişe ile
dikkatleri üzerine çeken bu salgın ile ilgili hala öngörülemeyen birçok nokta
bulunmaktadır. Virüsün genetiği ve biyolojisi, neden olduğu enfeksiyonun
klinik seyri ve komplikasyonları, yeni aşı ve ilaç çalışmaları ve salgının
boyutları ile ilgili literatüre yoğun bir şekilde her gün yeni bilgiler
eklenmektedir. Bununla beraber virüsün koronavirus ailesindeki diğer virüs
türleri ile paylaştığı birçok ortak özellik bulunmakta ve bunların bilinmesi
SARS-CoV-2 salgınının nereye doğru gideceğini, aşıların olası
yararlılıklarını veya mutasyon hızı gibi bilinmeyen ve endişelere neden olan
konuların daha kolay anlaşılmasında önem taşımaktadır. Bu makalede
koronavirusların genel biyolojik ve genetik özellikleri ele alınarak
bunlardan bazılarının SARS-CoV-2 ile karşılaştırmaları yapılmıştır. |
Abstract Coronaviruses are well-defined
human and animal pathogens and are primarily associated with respiratory
tract infections in humans. The number of coronavirus species is close to 40
and seven of which are associated with human infections. While four of these
viruses (HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 and HCoV-HKU1) are respiratory
pathogens that cause seasonal infections, SARS-CoV and MERS-CoV, which are
especially encountered with hospital outbreaks, cause severe acute
respiratory infections and discovered in 2003 and
2012, respectively. A new species named SARS-CoV-2 due to its genomic
similarity with SARS-CoV by the International Virus Taxonomy Committee spread
to all the countries of the world within 3 months starting from China at the
end of 2019. There are many unpredictable points regarding this epidemic,
which attracted attention due to the collapse of health systems in developed
countries and widespread concern in the world. New information is
intensively added to the literature on the genetics and biology of the virus,
the clinical course and complications of the infection, new vaccine and drug
studies, and the extent of the outbreak. However, there are
many common features that the virus shares with other types of viruses in the
coronavirus family, and knowing them is important
for easier understanding of unknown and anxious issues such as where the
SARS-CoV-2 outbreak is going, the possible benefits of the vaccines, or the
rate of mutation. In this article, general biological and genetic
characteristics of coronaviruses are discussed and some of them are compared
with SARS-CoV-2. |
|||||||
Anahtar kelimeler: Covid 19, Pandemi, SARS-CoV, MERS-CoV. |
Keywords: Covid 19, Pandemic, SARS-CoV, MERS-CoV. |
|||||||
Şekil 1. Koronavirusların
konak çeşitliliği ve konaklar arası yayılımı. Şekil
1 png |
Figure 1. Host diversity
of coronaviruses and ve spreading between hosts. Figure 1 png |
|||||||
|
||||||||
Şekil 2.
Koronavirus virion yapısı ve temel proteinleri. Şekil
2 png |
Figure 2. Coronavirus
virion structure and viral proteins. Figure 2 png |
|||||||
|
||||||||
Şekil 3.
SARS-Cov-2 genomik yapısı (GenBank MN908947) ve diğer koronaviruslarla
benzerlik oranları. Şekil
3 png |
Figure 3. SARS-Cov-2
genomic structure (GenBank MN908947) and similarity rates with other
coronaviruses. Figure 3 png |
|||||||
|
||||||||
Şekil 4.
Koronaviruslarda hücresel replikasyon döngüsü. Şekil
4 png |
Figure 4. Cellular
replication cycle in coronaviruses. Figure 4 png |
|||||||
|
||||||||
Cite this
article |
||||||||
Hoşbul T, Şahiner F. Genomic and Biologic Characteristics of
SARS-CoV-2 and Other Coronaviruses. J Mol Virol Immunol 2020; 1(1): 18-29.
doi: 10.46683/jmvi.2020.2 |
||||||||
Cited by 6 articles |
||||||||
[1]
Şahiner F. Analysis of a News Article in the SARS-CoV-2 Pandemic and
Infodemic with Current Scientific Literature. J Mol Virol Immunol 2020; 1(2):
54-67. doi: 10.46683/jmvi.2020.13 |
||||||||
[2]
Güven A, Diken Allahverdi T, Güven ÖD. Coronavirus: A Biochemical
Approach. Sinop Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
2021; 6(1), 66-77. doi: 10.33484/sinopfbd.776394 |
||||||||
[3]
Tahtabasi M, Hosbul T, Karaman E, Akin Y, Konukoglu O, Sahiner F.
Does COVID-19 cause an increase
in spleen dimensions?
Possible effects of immune activation,
hematopoietic suppression and microthrombosis. Clin
Imaging 2021; 79: 104-9. doi: 10.1016/j.clinimag.2021.04.035 |
||||||||
[4] Hosbul T, Sahiner F. Viruses and the importance of virus
detection (Chapter 1). In: Denizli A, Saylan Y (eds), Biosensors for Virus
Detection (1st edition). 2021, IOP Publishing, Bristol, UK. pp:1-17. doi: 10.1088/978-0-7503-3867-7ch1 |
||||||||
[5] Karakuş H.
Innate Immune Response and Immune Evasion in Viral Infections. J Mol Virol
Immunol 2022; 3(1): 1-19. doi: 10.46683/jmvi.2022.44 |
||||||||
[6] Global
Surveillance Networks and International Health Regulations in the Early
Detection and Control of Epidemics. Life Med Sci 2022; 1(2): 69-78. doi: 10.54584/lms.2022.12 |
||||||||
dizinlerde ve veritabanlarında görüntüle |
:: |
view in indexes and databases |
||||||
|
||||||||
|
||||||||
|
||||||||
|
||||||||
|
||||||||
|
|
|||||||
|
||||||||
diğer
dizinler : kütüphaneler : yazılımlar : medya |
:: |
other
indexes : libraries: software : media |
||||||
|
||||||||
|
||||||||
|
||||||||
|
|
|||||||
|
||||||||
©Copyright JMVI.
Licenced by Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0). |
||||||||